22MMDB - Molekularna dijagnostika sa bioinformatikom
| Specifikacija predmeta | ||||
|---|---|---|---|---|
| Naziv | Molekularna dijagnostika sa bioinformatikom | |||
| Akronim | 22MMDB | |||
| Studijski program | Biohemijsko inženjerstvo i biotehnologija | |||
| Modul | ||||
| Nastavnik (predavač) | ||||
| Nastavnik/saradnik (vežbe) | ||||
| Nastavnik/saradnik (DON) | ||||
| Broj ESPB | 4.0 | Status predmeta | izborni predmet | |
| Uslovljnost drugim predmetom | Oblik uslovljenosti | |||
| Ciljevi izučavanja predmeta | Sticanje znanja o molekularnim tehnikama baziranim na genetskom materijalu koje se koriste za identifikaciju mikroorganizama | |||
| Ishodi učenja (stečena znanja) | Nakon kursa student će posedovati teorijska znanja o molekularnoj osnovi za sistematiku živih bića, teorijska i praktična znanja o primeni 16/18 S rRNK molekula za identifikaciju organizama, teorijska i praktična znanja o molekularnim tehnikama za analizu kompleksnih mikrobnih ekosistema u hrani, vodi i u drugim biološkim sistemima. | |||
| Sadržaj predmeta | ||||
| Sadržaj teorijske nastave | Teorijske osnove o sistematici živih bića baziranoj na DNK sekvencama, potom i prednosti molekularnih metoda za analizu (kompleksnih) mikrobnih ekosistema. Akcenat predmeta je na objašnjenu principa i interpretaciji podataka dobijenih pomoću sledećih molekularnih tehnika: izolacije nukleinskih kiselina, tehnike Pi-Si-Ar; detekcije na osnovu ligacije, hibridizacije sa DNK probama na ćelijskom nivou ili na platformama DNK čipovima, tehnike profilisanja poput tehnike gel elektroforeze u prisustvu gradijenta denaturišuće komponente. Predmet će takođe dati osnove za bioinformatičke analize koje uključuju pretraživanje javnih baza podataka i poređenje i identifikaciju DNK sekvenci. | |||
| Sadržaj praktične nastave | Praktičnu nastavu čine laboratorijske vežbe koje uključuju primenu nekih od teorijski izučenih molekularnih tehnika za dijagnostiku model ekosistema. Bioinformatičke vežbe uključuju analizu 16S ili 18S rRNK sekvenci u softverskim paketima ClustalX, R i ARB, pretraživanje javnih baza podataka i multivarijantna statistička obrada podataka. | |||
| Literatura | ||||
| ||||
| Broj časova aktivne nastave nedeljno tokom semestra/trimestra/godine | ||||
| Predavanja | Vežbe | DON | Studijski i istraživački rad | Ostali časovi |
| 1 | 1 | 1 | ||
| Metode izvođenja nastave | Predavanja, praktična nastava (laboratorijske i bioinformatičke vežbe). | |||
| Ocena znanja (maksimalni broj poena 100) | ||||
| Predispitne obaveze | Poena | Završni ispit | Poena | |
| Aktivnosti u toku predavanja | 20 | Pismeni ispit | ||
| Praktična nastava | 20 | Usmeni ispit | 60 | |
| Projekti | ||||
| Kolokvijumi | ||||
| Seminari | ||||