22Д130 - Молекуларна дијагностика са биоинформатиком
| Спецификација предмета | ||||
|---|---|---|---|---|
| Назив | Молекуларна дијагностика са биоинформатиком | |||
| Акроним | 22Д130 | |||
| Студијски програм | Биохемијско инжењерство и биотехнологија | |||
| Модул | ||||
| Наставник (предавач) | ||||
| Наставник/сарадник (вежбе) | ||||
| Наставник/сарадник (ДОН) | ||||
| Број ЕСПБ | 5.0 | Статус предмета | изборни предмет | |
| Условљност другим предметом | Облик условљености | |||
| Циљеви изучавања предмета | Стицање знања о молекуларним техникама базираним на генетском материјалу које се користе за идентификацију микроорганизама | |||
| Исходи учења (стечена знања) | Након курса студент ће поседовати теоријска знања о молекуларној основи за систематику живих бића, теоријска и практична знања о примени 16/18 С рРНК молекула за идентификацију организама, теоријска и практична знања о молекуларним техникама за анализу комплексних микробних екосистема у храни, води и у другим биолошким системима. | |||
| Садржај предмета | ||||
| Садржај теоријске наставе | Tеоријске основе о систематици живих бића базираној на ДНК секвенцамa, потом и предности молекуларних метода за анализу (комплексних) микробних екосистема. Акценат предмета је на објашњену принципа и интерпретацији података добијених помоћу следећих молекуларних техника: изолације нуклеинских киселина, технике Пи-Си-Ар; детекције на основу лигације, хибридизације са ДНК пробама на ћелијском нивоу или на платформама ДНК чиповима, технике профилисања попут технике гел електрофорезе у присуству градијента денатуришуће компоненте. Предмет ће такође дати основе за биоинформатичке анализе које укључују претраживање јавних база података и поређење и идентификацију ДНК секвенци. | |||
| Садржај практичне наставе | Практичну наставу чини истраживачки рад студената који укључује примену неких од теоријски изучених молекуларних техника за дијагностику модел екосистема. Биоинформатичке вежбе укључују анализу 16S или 18S рРНК секвенци у софтверским пакетима ClustalX, R и ARB, претраживање јавних база података и мултиваријантна статистичка обрада података. | |||
| Литература | ||||
| ||||
| Број часова активне наставе недељно током семестра/триместра/године | ||||
| Предавања | Вежбе | ДОН | Студијски и истраживачки рад | Остали часови |
| 2 | 1 | |||
| Методе извођења наставе | Предавања, студијски истраживачки рад. | |||
| Оцена знања (максимални број поена 100) | ||||
| Предиспитне обавезе | Поена | Завршни испит | Поена | |
| Активности у току предавања | 20 | Писмени испит | ||
| Практична настава | 20 | Усмени испит | 60 | |
| Пројекти | ||||
| Колоквијуми | ||||
| Семинари | ||||